FASTn Discovery - cкрининг с высочайшей производительностью

Discovery - это программный блок для
Xcalibur для автоматического скрининга при комбинаторном химическом анализе. Discovery контролирует ввод образца, запись полной информации, обработку результатов и вывод для комбинаторных приложений. Пакет программного обеспечения обеспечивает быстрое визуальное подтверждение и использует рассеяние УФ света в детекторе фото-диодная матрица PDA для оценки чистоты образца.

Браузер Discovery

Браузер Discovery специально устроен так, чтобы обеспечивать средства просмотра файлов с результатами, полученными путем обработки данных. Он позволяет просматривать в графическом виде спектры и хроматографические данные. Браузер системы Discovery состоит из нескольких полей.

Организация панелей

Большинство панелей можно переместить со своих исходных позиций на дисплее в любое удобное место. Их можно "зацепить" левой кнопкой мыши и перетащить на новое место. Если панель передвигается к краю главного окна браузера, то она автоматически примыкает к его границе. Из меню панелей их можно включать и выключать.

Инструментальная панель браузера Discovery

Toolbar (инструментальная панель) обычно выводится в верхней части главного окна браузера Discovery и позволяет выполнять некоторые общие операции путем одиночного щелчка мышью на соответствующую программную кнопку. Программные кнопки инструментальной панели описаны ниже.

Oткрыть файл отчета Discovery Перейти к предыдущей пластине
Напечатать отчет Выбрать пластину вручную
Перейти к первой лунке текущей пластины Перейти к следующей пластине
Перейти к предыдущей лунке текущей пластины Выключить/включить панель микротитра
Manually select a well on the current plate Выключить/включить панель итогов по соединению
Перейти к следующей лунке текущей пластины Выключить/включить панель информации по образцу
Go to the last well on the current plate Восстановить текущий спектр в исходном диапазоне


Панель микротитровой пластины

Панель микротитровой пластины показывает изображение пластины и различными цветами пусты ли лунки на ней или содержат образцы, а также найдены ли какие-либо выбранные соединения в данном образце. По умолчанию установлены следующие цвета: серый для пустой лунки, зеленый для той, в которой найдено соединение, красный для той, в которой не найдено ни одно из заданных соединений.
Текущий образец/лунка выделяются на панели и могут быть изменены путем щелчка левой кнопки мыши на изобращение лунки.

Панель информации о соединении (Суммарного отчета)

Панель суммарного отчета по соединению показывает список искомых в текущем образце соединений. Паказывается масса соединения, за которой следует его химическая формула (если эта информация доступна). Перед каждой массой стоит значок галочки или перечеркивания.

Знак показывает, что соединение найдено в образце.

Знак показывает, что соединение не найдено в образце.

Панель информации об образце

Панель информации об образце состоит из нескольких полей, представляющих более детальную информацию о текущем образце.

Перечень функций/спектров показывает какие функции сохранены и перечень спектров, сохраненных для каждой функции. Показан тип функции, за которой следует режим ионизации (например, MS (ESI+)). Двойной щелчок левой кнопки мыши на программную кнопку на функции показывает список спектров, сохраненных с этой функцией. Информация для каждого спектра показывает где он был получен и время удерживания пика, в котором он был получен (например, DAD (4.651) ) одиночный щелчок левой кнопки мыши на какую-либу строку списка выводит на дисплей подробную информацию по этому спектру.

Поспектровый суммарный отчет показывает список компонентов, по которым проводился поиск в данном спектре. Показываются массы компонентов и вычисленное значение, характеризующее их чистоту. Перед каждой массой выставляется значок галочки или перечеркивания.

Знак показывает, что масс-спектр соединения найден в текущем спектре.

Крестик перечеркивания показывает, что данное соединение не найдено в текущем спектре.

Статус соединения "найдено" в каком-либо конкретном спектре может быть модифицирован пользователем. Это может быть сделано путем выбора желаемой позиции в перечне (однократным щелчком левой кнопки мыши) и переключением с использованием выбора меню Edit.

Искомые в спектре массы показываются как перечень масс искомого соединения и (возможно) найденых в текущем образце. Каждая строка перечня состоит из массы, ожидаемой массы (масса плюс аддукт), и, если искомая масса найдена в спектре образца, реальной массы, обнаруженной в спектре с величинами интенсивности в процентах и абсолютных значениях.

Панель спектра

Панель спектра показывает график спектра для данной выборки в списке функция/спектр (Смотрите Информационная панель спектра). выводимый на дисплей текущий диапазон может быть модифицирован с помощью нажатия левой кнопки мыши на на графике и перетягивания курсора на новое место. Когда кнопка мыши будет отпущена, спектр будет перерисован и показан в новом диапазоне.

Диапазон спектра может быть возвращен на величину по умолчанию с помощью щелчка мыши на программную кнопку на инструментальной панели окна или выбором команды Reset Spectrum Range в меню View.

Выбор пластины

Выбор текущей пластины может быть сделан с помощью следующих программных кнопок инструментальной панели или соотвествующих им команд меню:

Предыдущая пластина в меню (старт) Go
Выбрать пластину в (Select Plate...) в меню Go
Следующая пластина в меню (старт) Go

Каманды выбора следующей и предыдущей пластин проходят по циклу через все доступные пластины. Команда выбора пластины открывает диалоговое окно, показывающее доступные платсины, текущая пластина может быть выбрана щелчком левой кнопки мыши на ее изображение.

Выбор образца (лунки)

Tекущий образец может быть выбран либо щелчком мыши на изображение лунки на панели микротитровой пластины, либо с использованием кнопок инструментальной панели (или соответсвующих им команд в меню):

Первая лунка в меню старта
Предыдущая лунка в меню старта
Выбрать лунку в меню старта
Следующая лунка в меню старта
Последняя лунка в меню старта

Команды "следующая" и "предыдущая" лунки приводят к переходу на один шаг на текущей пластине. Команды "первая" и "последняя" лунки приводят к перепрыгиваню к соотвествующим лункам на этой же пластине. Команда "выбрать лунку" вызывает диалоговое окно, показывающее текущий выбор. Изменение выбора и щелчок мыши на кнопку OK приводит к установке соотвествующей лунки.

Вывод параметров образца

Суммарный отчет по параметрам, использованным для процесса обработки результатов, может быть просмотрен с помощью выбора команды Sample Parameters... из меню View.

Опции дисплея

Выбор выводимых на дисплей панелей может быть модифицирован путем включения и выключения панелей. Это можно выполнить путем выбора соответствующих панелей из перечня меню панелей. Некоторые из панелей могут быть также отключены с использованием следующих программных кнопок инструментальной панели:

Информация по пластина в меню View
Суммарная информация по соединению в меню View
Информация по образцу в меню View

Диалог опций может быть активирован выбором команды Options... в меню панели View.

Таблица спектра позволяет выводить на дисплей установки панели спектра. Цвета описанных данных могут быть выбраны путем использования мыши на программных кнопках выбора цветов, затем на дисплей будет выводено диалоговое окно выбора.
Группа аннтотаций имеет следующие параметры:
Включить/выключить вывод аннотаций.
Decimal Places - сколько знаков после запятой следует выводить.
Таблица микротитровой пластины позволяет выводить установки панели микротитровой пластины. Цвета могут быть выбраны как предыдущем случае.

Группа Plate включает следующие параметры:
Origin - устанавливает ярлыки колонок/рядов на панели микротитровой пластины.
Column Labels - определяет использование чисел или букв для наименования колонок.
Row Labels - определяет использование чисел или букв для наименования рядов.

Модификация файла CSV

Если для создания списка образцов и отчета внутри программного обеспечения Discovery использовался файл CSV (возможно созданный), то команда модификации может быть использована для записи информации обратно в тот же файл. Меню будет доступно лишь в том случае, когда файл CSV был использован для создания отчета и шаблон присутсвует в системе (оба файла находятся в своих первичных директориях).

Команда модификации файла СSV в меню редактирования вызывает следующее диалоговое окно:

Каждое поле, подлежащее модификации, представлено своим CSV эквивалентом - то есть названием, используемым в CSV файле для идентификации поля этого типа. Когда нажимается кнопка Update, файл CSV прочитывается и, если заголовок устанавленный в окне "CSV Equivalent" найден, эта колонка заполняется соотвествующей каждому образцу информацией.

Обратно в файл CSV может быть записан только найденный для образца результат. В зависимости от статуса найденого для оборазца в выделенной для этого колонке файла CSV для каждого будет записано "Yes" или "No".

ВЕРНУТЬСЯ К СИСТЕМАМ FASTnВЕРНУТЬСЯ К ЖХ/МС СИСТЕМАМ

[ Применения масс-спектрометрии ] [ Применения жидкостной хроматографии ] [ Колонки для ВЭЖХ ] [ Жидкостная хроматография ]
[
Хромато-масс-спектрометры ] [ ВЭЖХ / МС системы ] [ Масс-спектрометры для элементного и изотопного анализа ] [ Методы анализа ]
[
Расходные материалы, запчасти ] [ MALDI TOF ] [ Капиллярный электрофорез ] [ Пользователи в России и СНГ
]
[
Выставки, конференции, симпозиумы ] [ Экспертизы ] [ Популярно о масс-спектрометрии ] [ Новости ]
[
Курс валют, погода, деловые индексы ] [ Контакты ]